Основные направления деятельности

Основные направления научной деятельности

В настоящее время лаборатория оснащена современным оборудованием, что позволяет проводить научные и прикладные исследования на самом высоком уровне по следующим направлениям: 

  • молекулярно-эпидемиологический мониторинг (определение генотипов/подтипов) циркуляции ВИЧ-1, вирусов гепатитов В, С и вируса папилломы человека (ВПЧ) высокого онкогенного риска в разных группах населения;
  • определение мутаций резистентности к лекарственным средствам антивирусной терапии ВИЧ-1, гепатитов В, С;
  • поиск новых антивирусных соединений-ингибиторов ВИЧ-1;
  • проведение экспертных исследований по расшифровке случаев умышленного инфицирования или заражения через кровь и ее продукты (ВИЧ, вирусами гепатитов В и С), расшифровка очаговых случаев инфицирования вирусами гепатитов В и С;
  • экспертное исследование новых дезинфектантов для последующего их использования в отношении инактивации ВИЧ, гепатитов В и С;
  • лабораторная диагностика ВИЧ, гепатитов В и С и других возбудителей с использованием современных молекулярно-биологических методов;
  • помощь лабораториям центра и другим учреждениям республики в определении генотипов/подтипов, мутаций резистентности вирусных и бактериальных патогенов, возбудителей болезней человека и животных.

В 2019 году выполняются следующие задания: 

1. «Определить распространенность HBsAg – ускользающих мутаций и HBeAg негативных случаев у пациентов с хронической формой вирусного гепатита В, разработать диагностическую тест-систему для диагностики вирусного гепатита В в режиме реального времени» подпрограммы 1  «Инновационные биотехнологии 2020» государственной программы «Наукоемкие технологии и техника» на 2016 – 2020 годы (раздел «Медицинские биотехнологии);

2. «Разработать метод определения резистентности вируса гепатита С к препаратам прямого действия и определить их распространенность у инфицированных пациентов с целью своевременной корректировки схем лечения» подпрограммы «Инфекции и биологическая безопасность» ГНТП «Новые методы оказания медицинской помощи» 2016-2020;

3. «Разработать диагностическую тест-систему для определения мутаций резистентности в р участке генома вируса гепатита В (ВГВ) у пациентов с хронической формой гепатита в, находящихся на антивирусной терапии» ГНТП «Новые методы оказания медицинской помощи» 2016-2020 гг. подпрограммы «Инфекции и биологическая безопасность» ;

4. Изучение степени инактивации ВИЧ при повторном использовании световодного инструмента при лазерных вмешательствах в образцах изделий производства ЗАО «ФОТЭК».

Международное сотрудничество:

1. Генотипирование и определение однонуклеотидных полиморфизмов микроорганизмов: сравнительные исследования нуклеотидных последовательностей, полученных на генетических анализаторах ABI 3500 (Applied Biosystems.США) и Нанофор (Синтол, Россия).

2. Выполняется международный проект по предотвращению распространения резистентных штаммов ВИЧ в странах ВЕЦА (Россия, Беларусь, Армения, Азербайждан, кыргызтан, Узбекистан, Таджикистан).

Перспективные исследования и задания, планируемые к выполнению:

1. Разработать и внедрить методы выявления лекарственной устойчивости ВИЧ-1 к ингибиторам интегразы и фармакогенетического маркера (аллель HLA-B*57:01) с целью оптимизации схемы антиретровирусной терапии;

2. Разработать и внедрить алгоритм молекулярно-генетического определения лекарственной устойчивости доминирующих генетических вариантов вируса гепатита С к ингибиторам репликации вируса;

3. Разработать и внедрить метод молекулярного типирования антигенных детерминант HBsAg вируса гепатита В;

4. Оценить распространённость клинически значимых мутаций к ингибиторам протеазы и обратной транскриптазы ВИЧ у пациентов, длительно получающих лечение антиретровирусными лекарственными средствами

Основные направления научно-практической деятельности

1. Впервые среди стран СНГ определены виды, генотипы и подтипы вируса папилломы человека (ВПЧ) высокого онкогенного риска, разработана система молекулярно-эпидемиологического мониторинга за ВПЧ высокого онкогенного риска. Отработаны условия проведения ПЦР, секвенирующей ПЦР и секвенирование с парами праймеров к L1, Е6/Е7 участкам ВПЧ-16, 18, 45. Проведенное секвенирование и последующий филогенетический анализ по данным участкам более 150 образцов позволили установить, что на территории Республики Беларусь циркулируют в основном варианты ВПЧ-16, 18, 45, занесенные недавно из стран юго-восточной Азии. Вместе с тем, было показано, что на территории страны циркулируют «старые» местные варианты ВПЧ высокого онкогенного риска, а также вирусы с Африканского континента, и это необходимо учитывать при выборе вакцин и оценке эффективности поствакцинального иммунитета. Впервые описан новый вариант ВПЧ-16 типа.

2. ВИЧ-инфекция: впервые мире описана новая уникальная рекомбинантная форма ВИЧ-1, на которую в 2013 г. получен патент Республики Беларусь № 18124, разработаны и успешно используются в лаборатории тест-системы для генотипирования ВИЧ-1 по участкам генов gag-env и pol ВИЧ-1 (рег. удостоверения № ИМ-7.95957 и ИМ-7.103886), позволяющие проводить диагностику и определять подтипы вируса, циркулирующие на территории Беларуси, расшифровывать случаи умышленного инфицирования, вспышки ВИЧ-инфекции и случаи инфицирования через кровь и ее продукты. Разработана и применяется система молекулярно-эпидемиологического мониторинга циркуляции подтипов ВИЧ-1 на территории страны. Показано, что на территории Республики Беларусь продолжает доминировать подтип А1 ВИЧ-1, на который приходится более 90% всех новых случаев инфицирования. В тоже время, в стране увеличивается количество выявленных рекомбинантных форм, на которые уже приходится более 8% новых случаев инфицирования, при этом, если ранее рекомбинантные формы на территорию страны «завозились» из-за пределов, то в последнее время наблюдается формирование новых рекомбинантных форм на территории страны. Впервые в Гомельской области у двоих пациентов выявлен подтип G ВИЧ-1 и показано, что оба пациента получили вирус из одного источника, а в Минской области у двоих пациентов выявлен новый вариант рекомбинантной формы CRF02_AG. В 300 (54,80%) из 547 изолированных и амплифицированных образцах РНК ВИЧ были выявлены мутации резистентности высокого уровня. Всего на резистентность было проверено около 1100 образцов сыворотки/плазмы крови. Определение мутаций резистентности осуществляли как с использованием коммерческой тест-системы, так и с применением разработанной нами тест-системы для генотипирования и определения мутаций резистентности ВИЧ-1. Своевременное определение резистентных штаммов ВИЧ-1 позволяет эффективнее использовать разные схемы терапии и значительно улучшать жизненный статус пациентов. В Международную базу данных GenBank передано более 300 последовательностей ВИЧ-1.

Совместно с российскими коллегами получено 6 патентов Российской Федерации на новые антивирусные соединения.

3. Гепатиты В и С

Гепатит В. Разработана система молекулярно-эпидемиологического мониторинга циркуляции ВГВ. Выполняются исследования по генотипированию и установлению клинически значимых мутаций вируса к средствам противовирусной терапии, определению HBsAg ускользающих мутаций, мутаций в HBeAg ВГВ.

Гепатит С. Разработана система молекулярно-эпидемиологического мониторинга за циркуляцией ВГС и метод выявления мутаций лекарственной устойчивости ВГС к лекарственным средствам прямой противовирусной терапии. 

В лаборатории успешно осуществляется работа по оказанию платных услуг населению по диагностике, генотипированию и определению лекарственной устойчивости парентеральных гепатитов В и С, ВИЧ к средствам противовирусной терапии.

На базе лаборатории функционирует республиканская референс-лаборатория генодиагностики ВИЧ-инфекции, парентеральных гепатитов В и С.